Le Conseil consultatif, présidé par le Président de la Fondation Anna Lindh, est responsable de faire des recommandations concernant les orientations de la politique stratégique de la Fondation au Conseil des gouverneurs, au Directeur et aux réseaux nationaux. Il est composé de dix-huit éminents individus issus du domaine du dialogue interculturel et de la coopération régionale, dont neuf des pays de l'UE et neuf des pays partenaires de la Méditerranée.

Les membres élus du Conseil consultatif sont:

Besnik Mustafaj (Albanie), Aïcha Kassoul (Algérie), Nevine Simaika Halim (Égypte), Ron Barkai (Israël), Rowaida Al-Ma’aitah (Jordanie), Antoine Nasri Messarra (Liban), Taleb Mahmoud Omran (Syrie), Mohamed Mahjoub (Tunisie), Ayse Sumru Noyan (Turquie), Heidi Dumreicher (Autriche), Eduard Gombard (République Tchèque), Tuomo Melasuo (Finlande), Caroline Fourest (France), Aliki Moschis-Gauguet (Grèce), Lucio Guerrato (Italie), Karina Petersone (Lettonie), Nevenka Koprivsek (Slovénie), Sara Silvestri (Royaume-Uni).